آمونیاک با افزایش pH می تواند کوتیکول ( لایه ی بیرونی موی سر) را باز کند و توسط کورتکس (لایه ی بعد از کوتیکول) تجزیه گردد. همین امر دلیلی بر اثر بخشی زیاد این ترکیب در فرایند رنگ مو می باشد. با وجود اثر بخشی فراوان این رنگ ها می توان شاهد خشک شدن موها بعد از رنگ شدن با آن ها بود. زیرا با رسیدن آمونیاک به لایه ی کورتکس ، رطوبت مو توسط این ماده جذب می گردد. موهایی که از این طریق آسیب میبینند معمولا شروع به ریزش میکنند و همچنین برای ترمیم شدن باید زمان زیادی را صبر کنید.